Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.6 ms