Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms