Protein–RNA interactions for Protein: P30038

ALDH4A1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH4A1P30038 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH4A1P30038 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms