Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GTF2E2P29084 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms