Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC19■□□□□ 0.63
POLD1P28340 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POLD1P28340 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POLD1P28340 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POLD1P28340 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POLD1P28340 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POLD1P28340 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
POLD1P28340 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POLD1P28340 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
POLD1P28340 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POLD1P28340 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
POLD1P28340 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC19■□□□□ 0.63
POLD1P28340 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
POLD1P28340 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC19■□□□□ 0.63
POLD1P28340 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
POLD1P28340 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
POLD1P28340 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
POLD1P28340 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
POLD1P28340 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
POLD1P28340 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
POLD1P28340 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
POLD1P28340 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
POLD1P28340 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POLD1P28340 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
POLD1P28340 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
POLD1P28340 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
POLD1P28340 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POLD1P28340 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POLD1P28340 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
POLD1P28340 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
POLD1P28340 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POLD1P28340 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POLD1P28340 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19■□□□□ 0.63
POLD1P28340 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POLD1P28340 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
POLD1P28340 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POLD1P28340 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC19■□□□□ 0.63
POLD1P28340 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
POLD1P28340 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
POLD1P28340 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
POLD1P28340 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
POLD1P28340 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC19■□□□□ 0.63
POLD1P28340 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POLD1P28340 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLD1P28340 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLD1P28340 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLD1P28340 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLD1P28340 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLD1P28340 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLD1P28340 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLD1P28340 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLD1P28340 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
POLD1P28340 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLD1P28340 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLD1P28340 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLD1P28340 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLD1P28340 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLD1P28340 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLD1P28340 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLD1P28340 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLD1P28340 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLD1P28340 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLD1P28340 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLD1P28340 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLD1P28340 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
POLD1P28340 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLD1P28340 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
POLD1P28340 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLD1P28340 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLD1P28340 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
POLD1P28340 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLD1P28340 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLD1P28340 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLD1P28340 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLD1P28340 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLD1P28340 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLD1P28340 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLD1P28340 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLD1P28340 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLD1P28340 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLD1P28340 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLD1P28340 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLD1P28340 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLD1P28340 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLD1P28340 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLD1P28340 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLD1P28340 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLD1P28340 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLD1P28340 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLD1P28340 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLD1P28340 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLD1P28340 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLD1P28340 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLD1P28340 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLD1P28340 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLD1P28340 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLD1P28340 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLD1P28340 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLD1P28340 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLD1P28340 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms