Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRZ1P23471 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRZ1P23471 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRZ1P23471 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRZ1P23471 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRZ1P23471 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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PTPRZ1P23471 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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PTPRZ1P23471 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRZ1P23471 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRZ1P23471 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRZ1P23471 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRZ1P23471 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRZ1P23471 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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PTPRZ1P23471 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRZ1P23471 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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PTPRZ1P23471 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRZ1P23471 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRZ1P23471 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRZ1P23471 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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PTPRZ1P23471 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRZ1P23471 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRZ1P23471 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRZ1P23471 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRZ1P23471 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRZ1P23471 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRZ1P23471 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRZ1P23471 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRZ1P23471 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRZ1P23471 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRZ1P23471 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRZ1P23471 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRZ1P23471 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRZ1P23471 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRZ1P23471 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRZ1P23471 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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PTPRZ1P23471 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRZ1P23471 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRZ1P23471 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRZ1P23471 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRZ1P23471 JPT2-203ENST00000382711 894 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRZ1P23471 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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PTPRZ1P23471 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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PTPRZ1P23471 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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PTPRZ1P23471 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRZ1P23471 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRZ1P23471 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRZ1P23471 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRZ1P23471 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRZ1P23471 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRZ1P23471 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRZ1P23471 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRZ1P23471 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRZ1P23471 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRZ1P23471 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRZ1P23471 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRZ1P23471 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRZ1P23471 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRZ1P23471 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRZ1P23471 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRZ1P23471 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRZ1P23471 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRZ1P23471 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRZ1P23471 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRZ1P23471 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRZ1P23471 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRZ1P23471 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRZ1P23471 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRZ1P23471 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRZ1P23471 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRZ1P23471 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRZ1P23471 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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