Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CALB2P22676 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CALB2P22676 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CALB2P22676 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CALB2P22676 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CALB2P22676 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CALB2P22676 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CALB2P22676 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CALB2P22676 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CALB2P22676 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CALB2P22676 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CALB2P22676 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CALB2P22676 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CALB2P22676 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CALB2P22676 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CALB2P22676 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CALB2P22676 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CALB2P22676 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CALB2P22676 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CALB2P22676 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CALB2P22676 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CALB2P22676 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CALB2P22676 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CALB2P22676 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CALB2P22676 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CALB2P22676 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CALB2P22676 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CALB2P22676 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CALB2P22676 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CALB2P22676 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CALB2P22676 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CALB2P22676 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CALB2P22676 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CALB2P22676 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CALB2P22676 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CALB2P22676 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CALB2P22676 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CALB2P22676 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CALB2P22676 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CALB2P22676 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CALB2P22676 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CALB2P22676 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CALB2P22676 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CALB2P22676 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CALB2P22676 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CALB2P22676 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CALB2P22676 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CALB2P22676 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CALB2P22676 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CALB2P22676 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CALB2P22676 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CALB2P22676 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CALB2P22676 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CALB2P22676 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CALB2P22676 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CALB2P22676 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CALB2P22676 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CALB2P22676 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CALB2P22676 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CALB2P22676 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CALB2P22676 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CALB2P22676 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CALB2P22676 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CALB2P22676 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CALB2P22676 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CALB2P22676 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CALB2P22676 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CALB2P22676 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CALB2P22676 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CALB2P22676 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CALB2P22676 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CALB2P22676 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CALB2P22676 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CALB2P22676 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CALB2P22676 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CALB2P22676 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CALB2P22676 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CALB2P22676 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CALB2P22676 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CALB2P22676 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CALB2P22676 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CALB2P22676 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CALB2P22676 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CALB2P22676 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CALB2P22676 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CALB2P22676 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CALB2P22676 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CALB2P22676 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CALB2P22676 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CALB2P22676 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CALB2P22676 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CALB2P22676 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CALB2P22676 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CALB2P22676 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CALB2P22676 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CALB2P22676 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CALB2P22676 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CALB2P22676 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CALB2P22676 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CALB2P22676 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms