Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms