Protein–RNA interactions for Protein: P19013

KRT4, Keratin, type II cytoskeletal 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT4P19013 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT4P19013 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT4P19013 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT4P19013 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT4P19013 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT4P19013 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT4P19013 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT4P19013 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT4P19013 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT4P19013 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT4P19013 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT4P19013 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT4P19013 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT4P19013 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT4P19013 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT4P19013 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT4P19013 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT4P19013 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT4P19013 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT4P19013 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT4P19013 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT4P19013 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT4P19013 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT4P19013 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT4P19013 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT4P19013 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT4P19013 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT4P19013 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT4P19013 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT4P19013 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT4P19013 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT4P19013 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT4P19013 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT4P19013 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT4P19013 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT4P19013 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT4P19013 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT4P19013 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT4P19013 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT4P19013 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT4P19013 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT4P19013 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT4P19013 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT4P19013 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT4P19013 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT4P19013 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT4P19013 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT4P19013 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT4P19013 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT4P19013 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT4P19013 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT4P19013 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT4P19013 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT4P19013 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT4P19013 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT4P19013 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT4P19013 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT4P19013 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT4P19013 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT4P19013 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT4P19013 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT4P19013 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT4P19013 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT4P19013 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT4P19013 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT4P19013 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT4P19013 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT4P19013 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT4P19013 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT4P19013 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT4P19013 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT4P19013 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT4P19013 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT4P19013 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT4P19013 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT4P19013 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT4P19013 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT4P19013 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT4P19013 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT4P19013 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT4P19013 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT4P19013 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT4P19013 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT4P19013 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT4P19013 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT4P19013 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT4P19013 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT4P19013 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT4P19013 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT4P19013 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT4P19013 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT4P19013 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT4P19013 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT4P19013 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT4P19013 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT4P19013 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT4P19013 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT4P19013 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT4P19013 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT4P19013 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms