Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNB1P11230 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNB1P11230 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNB1P11230 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNB1P11230 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNB1P11230 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNB1P11230 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNB1P11230 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNB1P11230 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNB1P11230 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNB1P11230 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNB1P11230 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms