Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
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