Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGFRP00533 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGFRP00533 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGFRP00533 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGFRP00533 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGFRP00533 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGFRP00533 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGFRP00533 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGFRP00533 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGFRP00533 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGFRP00533 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
EGFRP00533 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
EGFRP00533 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
EGFRP00533 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
EGFRP00533 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGFRP00533 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGFRP00533 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGFRP00533 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGFRP00533 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGFRP00533 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGFRP00533 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
EGFRP00533 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
EGFRP00533 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGFRP00533 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
EGFRP00533 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGFRP00533 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
EGFRP00533 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGFRP00533 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGFRP00533 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGFRP00533 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGFRP00533 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGFRP00533 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGFRP00533 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGFRP00533 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGFRP00533 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGFRP00533 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGFRP00533 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGFRP00533 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGFRP00533 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGFRP00533 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGFRP00533 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGFRP00533 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGFRP00533 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGFRP00533 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGFRP00533 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGFRP00533 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGFRP00533 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGFRP00533 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGFRP00533 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGFRP00533 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGFRP00533 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGFRP00533 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGFRP00533 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGFRP00533 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGFRP00533 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGFRP00533 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGFRP00533 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGFRP00533 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGFRP00533 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGFRP00533 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGFRP00533 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGFRP00533 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
EGFRP00533 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGFRP00533 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
EGFRP00533 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGFRP00533 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGFRP00533 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGFRP00533 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGFRP00533 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGFRP00533 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGFRP00533 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
EGFRP00533 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGFRP00533 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
EGFRP00533 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGFRP00533 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGFRP00533 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGFRP00533 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGFRP00533 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGFRP00533 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGFRP00533 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGFRP00533 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGFRP00533 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGFRP00533 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGFRP00533 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGFRP00533 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
EGFRP00533 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGFRP00533 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGFRP00533 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGFRP00533 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGFRP00533 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGFRP00533 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGFRP00533 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGFRP00533 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGFRP00533 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
EGFRP00533 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGFRP00533 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGFRP00533 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGFRP00533 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGFRP00533 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGFRP00533 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms