Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAPBO95292 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAPBO95292 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAPBO95292 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAPBO95292 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAPBO95292 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAPBO95292 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAPBO95292 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAPBO95292 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAPBO95292 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAPBO95292 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VAPBO95292 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAPBO95292 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAPBO95292 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAPBO95292 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAPBO95292 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VAPBO95292 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAPBO95292 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAPBO95292 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VAPBO95292 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VAPBO95292 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VAPBO95292 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VAPBO95292 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VAPBO95292 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VAPBO95292 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VAPBO95292 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VAPBO95292 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAPBO95292 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAPBO95292 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAPBO95292 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAPBO95292 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAPBO95292 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAPBO95292 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAPBO95292 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VAPBO95292 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VAPBO95292 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAPBO95292 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VAPBO95292 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAPBO95292 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VAPBO95292 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAPBO95292 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAPBO95292 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAPBO95292 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAPBO95292 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAPBO95292 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VAPBO95292 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VAPBO95292 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAPBO95292 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAPBO95292 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAPBO95292 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAPBO95292 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAPBO95292 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAPBO95292 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAPBO95292 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAPBO95292 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAPBO95292 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAPBO95292 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VAPBO95292 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAPBO95292 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAPBO95292 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAPBO95292 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAPBO95292 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAPBO95292 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAPBO95292 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAPBO95292 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAPBO95292 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAPBO95292 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAPBO95292 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAPBO95292 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAPBO95292 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAPBO95292 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAPBO95292 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAPBO95292 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAPBO95292 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAPBO95292 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAPBO95292 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
VAPBO95292 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAPBO95292 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAPBO95292 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAPBO95292 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAPBO95292 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAPBO95292 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAPBO95292 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAPBO95292 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAPBO95292 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAPBO95292 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAPBO95292 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAPBO95292 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAPBO95292 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAPBO95292 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAPBO95292 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
VAPBO95292 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAPBO95292 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAPBO95292 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAPBO95292 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
VAPBO95292 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAPBO95292 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAPBO95292 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAPBO95292 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAPBO95292 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms