Protein–RNA interactions for Protein: O60938

KERA, Keratocan, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KERAO60938 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KERAO60938 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KERAO60938 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KERAO60938 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KERAO60938 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KERAO60938 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KERAO60938 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KERAO60938 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KERAO60938 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KERAO60938 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KERAO60938 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KERAO60938 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KERAO60938 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KERAO60938 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KERAO60938 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KERAO60938 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KERAO60938 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KERAO60938 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KERAO60938 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KERAO60938 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KERAO60938 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KERAO60938 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KERAO60938 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KERAO60938 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KERAO60938 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KERAO60938 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KERAO60938 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KERAO60938 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KERAO60938 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KERAO60938 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KERAO60938 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KERAO60938 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KERAO60938 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KERAO60938 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KERAO60938 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KERAO60938 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KERAO60938 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KERAO60938 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KERAO60938 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KERAO60938 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KERAO60938 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KERAO60938 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KERAO60938 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KERAO60938 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KERAO60938 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KERAO60938 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KERAO60938 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KERAO60938 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KERAO60938 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KERAO60938 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KERAO60938 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KERAO60938 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KERAO60938 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KERAO60938 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KERAO60938 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KERAO60938 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KERAO60938 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KERAO60938 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KERAO60938 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KERAO60938 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KERAO60938 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KERAO60938 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KERAO60938 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KERAO60938 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KERAO60938 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KERAO60938 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KERAO60938 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KERAO60938 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KERAO60938 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KERAO60938 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KERAO60938 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KERAO60938 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KERAO60938 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KERAO60938 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KERAO60938 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KERAO60938 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KERAO60938 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KERAO60938 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KERAO60938 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KERAO60938 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KERAO60938 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KERAO60938 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KERAO60938 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KERAO60938 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KERAO60938 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KERAO60938 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KERAO60938 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KERAO60938 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KERAO60938 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KERAO60938 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KERAO60938 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KERAO60938 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KERAO60938 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KERAO60938 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KERAO60938 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KERAO60938 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
KERAO60938 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KERAO60938 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KERAO60938 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KERAO60938 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms