Protein–RNA interactions for Protein: O43752

STX6, Syntaxin-6, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX6O43752 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
STX6O43752 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
STX6O43752 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
STX6O43752 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
STX6O43752 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
STX6O43752 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
STX6O43752 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
STX6O43752 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
STX6O43752 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
STX6O43752 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
STX6O43752 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
STX6O43752 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
STX6O43752 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
STX6O43752 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
STX6O43752 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
STX6O43752 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
STX6O43752 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
STX6O43752 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
STX6O43752 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
STX6O43752 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
STX6O43752 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
STX6O43752 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
STX6O43752 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
STX6O43752 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
STX6O43752 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
STX6O43752 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
STX6O43752 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
STX6O43752 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
STX6O43752 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
STX6O43752 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
STX6O43752 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
STX6O43752 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
STX6O43752 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
STX6O43752 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
STX6O43752 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
STX6O43752 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
STX6O43752 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
STX6O43752 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
STX6O43752 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
STX6O43752 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
STX6O43752 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
STX6O43752 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
STX6O43752 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
STX6O43752 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
STX6O43752 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
STX6O43752 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
STX6O43752 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
STX6O43752 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
STX6O43752 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
STX6O43752 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
STX6O43752 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
STX6O43752 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
STX6O43752 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
STX6O43752 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
STX6O43752 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
STX6O43752 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
STX6O43752 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
STX6O43752 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
STX6O43752 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
STX6O43752 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
STX6O43752 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
STX6O43752 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
STX6O43752 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
STX6O43752 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
STX6O43752 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
STX6O43752 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
STX6O43752 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
STX6O43752 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
STX6O43752 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
STX6O43752 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
STX6O43752 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
STX6O43752 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
STX6O43752 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
STX6O43752 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
STX6O43752 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
STX6O43752 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
STX6O43752 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
STX6O43752 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
STX6O43752 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
STX6O43752 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
STX6O43752 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
STX6O43752 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
STX6O43752 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
STX6O43752 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
STX6O43752 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
STX6O43752 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
STX6O43752 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
STX6O43752 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
STX6O43752 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
STX6O43752 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
STX6O43752 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
STX6O43752 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
STX6O43752 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
STX6O43752 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
STX6O43752 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
STX6O43752 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
STX6O43752 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
STX6O43752 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
STX6O43752 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
STX6O43752 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms