Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms