Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PHOX2AO14813 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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