Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F3O00716 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F3O00716 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F3O00716 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F3O00716 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F3O00716 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F3O00716 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F3O00716 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F3O00716 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F3O00716 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F3O00716 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F3O00716 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F3O00716 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F3O00716 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F3O00716 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F3O00716 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F3O00716 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F3O00716 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F3O00716 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F3O00716 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F3O00716 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F3O00716 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F3O00716 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F3O00716 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F3O00716 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F3O00716 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F3O00716 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F3O00716 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F3O00716 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F3O00716 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F3O00716 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F3O00716 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F3O00716 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F3O00716 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F3O00716 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F3O00716 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F3O00716 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F3O00716 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F3O00716 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F3O00716 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F3O00716 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F3O00716 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F3O00716 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F3O00716 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F3O00716 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F3O00716 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F3O00716 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F3O00716 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F3O00716 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F3O00716 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F3O00716 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F3O00716 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F3O00716 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F3O00716 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F3O00716 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F3O00716 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F3O00716 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F3O00716 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F3O00716 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F3O00716 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F3O00716 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F3O00716 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F3O00716 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F3O00716 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F3O00716 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F3O00716 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F3O00716 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F3O00716 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F3O00716 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F3O00716 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F3O00716 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F3O00716 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F3O00716 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F3O00716 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F3O00716 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F3O00716 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F3O00716 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F3O00716 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F3O00716 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F3O00716 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F3O00716 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F3O00716 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F3O00716 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F3O00716 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F3O00716 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F3O00716 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F3O00716 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F3O00716 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F3O00716 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F3O00716 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F3O00716 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F3O00716 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F3O00716 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F3O00716 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F3O00716 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F3O00716 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F3O00716 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F3O00716 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F3O00716 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F3O00716 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms