Protein–RNA interactions for Protein: O00591

GABRP, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit pi, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRPO00591 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABRPO00591 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABRPO00591 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABRPO00591 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABRPO00591 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABRPO00591 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABRPO00591 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABRPO00591 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABRPO00591 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABRPO00591 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABRPO00591 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABRPO00591 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABRPO00591 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABRPO00591 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABRPO00591 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABRPO00591 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABRPO00591 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABRPO00591 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABRPO00591 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABRPO00591 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABRPO00591 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABRPO00591 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABRPO00591 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABRPO00591 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
GABRPO00591 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
GABRPO00591 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABRPO00591 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABRPO00591 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABRPO00591 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABRPO00591 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
GABRPO00591 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABRPO00591 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
GABRPO00591 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABRPO00591 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABRPO00591 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABRPO00591 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABRPO00591 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABRPO00591 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
GABRPO00591 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABRPO00591 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABRPO00591 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABRPO00591 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABRPO00591 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABRPO00591 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABRPO00591 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABRPO00591 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABRPO00591 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABRPO00591 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABRPO00591 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABRPO00591 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
GABRPO00591 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABRPO00591 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
GABRPO00591 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABRPO00591 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABRPO00591 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABRPO00591 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABRPO00591 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABRPO00591 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABRPO00591 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABRPO00591 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABRPO00591 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABRPO00591 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABRPO00591 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABRPO00591 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABRPO00591 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABRPO00591 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABRPO00591 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABRPO00591 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABRPO00591 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABRPO00591 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABRPO00591 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
GABRPO00591 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABRPO00591 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
GABRPO00591 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABRPO00591 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABRPO00591 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABRPO00591 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABRPO00591 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABRPO00591 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABRPO00591 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABRPO00591 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABRPO00591 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABRPO00591 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABRPO00591 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABRPO00591 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABRPO00591 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABRPO00591 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABRPO00591 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABRPO00591 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABRPO00591 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABRPO00591 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABRPO00591 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABRPO00591 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABRPO00591 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABRPO00591 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABRPO00591 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABRPO00591 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABRPO00591 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABRPO00591 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABRPO00591 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms