Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HHLA1C9JL84 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms