Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms