Protein–RNA interactions for Protein: B1ALY0

PALM2-AKAP2, PALM2-AKAP2 readthrough (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2-AKAP2B1ALY0 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
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