Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms