Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms