Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms