Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULI2

RIMKLB, Beta-citrylglutamate synthase B, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMKLBQ9ULI2 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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