Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.2 ms