Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC7

GALP, Galanin-like peptide, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALPQ9UBC7 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms