Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms