Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms