Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX09

DDIT4, DNA damage-inducible transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT4Q9NX09 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DDIT4Q9NX09 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms