Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms