Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms