Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP91

SLC6A20, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A20Q9NP91 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLC6A20Q9NP91 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLC6A20Q9NP91 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLC6A20Q9NP91 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLC6A20Q9NP91 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLC6A20Q9NP91 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLC6A20Q9NP91 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLC6A20Q9NP91 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLC6A20Q9NP91 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLC6A20Q9NP91 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLC6A20Q9NP91 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLC6A20Q9NP91 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLC6A20Q9NP91 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLC6A20Q9NP91 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLC6A20Q9NP91 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLC6A20Q9NP91 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLC6A20Q9NP91 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLC6A20Q9NP91 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLC6A20Q9NP91 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLC6A20Q9NP91 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms