Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms