Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms