Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms