Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms