Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2AFJQ9BTM1 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms