Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms