Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms