Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY8

HOPX, Homeodomain-only protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPXQ9BPY8 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOPXQ9BPY8 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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