Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

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Length 751 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
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SEMA3CQ99985 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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SEMA3CQ99985 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
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SEMA3CQ99985 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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SEMA3CQ99985 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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SEMA3CQ99985 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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SEMA3CQ99985 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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SEMA3CQ99985 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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