Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PKP4Q99569 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PKP4Q99569 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PKP4Q99569 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PKP4Q99569 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PKP4Q99569 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PKP4Q99569 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PKP4Q99569 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PKP4Q99569 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PKP4Q99569 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PKP4Q99569 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PKP4Q99569 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PKP4Q99569 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PKP4Q99569 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PKP4Q99569 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PKP4Q99569 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PKP4Q99569 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PKP4Q99569 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PKP4Q99569 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PKP4Q99569 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PKP4Q99569 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PKP4Q99569 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PKP4Q99569 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PKP4Q99569 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PKP4Q99569 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PKP4Q99569 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PKP4Q99569 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PKP4Q99569 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PKP4Q99569 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PKP4Q99569 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PKP4Q99569 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PKP4Q99569 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PKP4Q99569 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PKP4Q99569 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PKP4Q99569 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PKP4Q99569 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PKP4Q99569 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PKP4Q99569 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PKP4Q99569 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PKP4Q99569 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PKP4Q99569 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PKP4Q99569 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PKP4Q99569 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PKP4Q99569 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PKP4Q99569 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PKP4Q99569 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PKP4Q99569 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PKP4Q99569 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PKP4Q99569 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PKP4Q99569 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PKP4Q99569 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PKP4Q99569 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PKP4Q99569 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PKP4Q99569 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PKP4Q99569 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PKP4Q99569 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PKP4Q99569 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PKP4Q99569 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PKP4Q99569 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PKP4Q99569 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PKP4Q99569 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PKP4Q99569 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PKP4Q99569 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PKP4Q99569 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PKP4Q99569 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PKP4Q99569 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PKP4Q99569 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PKP4Q99569 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PKP4Q99569 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PKP4Q99569 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PKP4Q99569 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PKP4Q99569 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PKP4Q99569 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PKP4Q99569 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PKP4Q99569 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PKP4Q99569 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PKP4Q99569 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PKP4Q99569 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PKP4Q99569 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PKP4Q99569 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PKP4Q99569 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PKP4Q99569 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PKP4Q99569 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PKP4Q99569 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PKP4Q99569 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PKP4Q99569 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PKP4Q99569 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PKP4Q99569 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PKP4Q99569 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PKP4Q99569 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PKP4Q99569 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PKP4Q99569 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PKP4Q99569 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms