Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SIN3AQ96ST3 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms