Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB3IPQ96QF0 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms