Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.4 ms