Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms