Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

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Length 1,375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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