Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY5

MVB12A, Multivesicular body subunit 12A, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12AQ96EY5 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.8 ms